该剧以明代武术为蓝本，以暗器为线索，讲述冷兵器向热兵器的转变。作为一个有名的堂堂正正的仲裁大厅，有两个“异类”，一个是仲裁熊云正（栾俊伟饰），另一个是仲察夜臧飞（赵鸿飞饰）。他们闻起来像，互相勾结。”他们像兄弟一样亲密，被宣扬武道正统的同志拒绝。直到他从秘密渠道得到了一把火枪，他对此很着迷，后来被叶臧飞终于抓住了凶手，找到了凶器，为自己的兄弟报仇，想要恢复武林秩序，但最终还是被枪杀了，谁也挡不住。时代进步，《暗器》将带你见证中国兵器的进化史。

武林即社会的浓缩，往往是黑暗的，自私的，但正如‘坏人’一直存在一样，‘好人’也不会被杀光，而且‘好人’和‘坏人’有时还会相互转换，更何况根本没有严格的好人和坏人。叶藏风算是一个从坏人变成好人的人，但无论如何，他始终都是别人用来杀人的暗器，而在大的环境下，个人根本没办法和整个武林对抗，暗器再厉害，也比不过狠毒的人心。最后陈仲裁嫁祸叶藏风紧要关头，被大仲裁就下，是在救陈仲裁吗，不是，那是在就叶藏风吗，显然也不全是，这可能就是大仲裁所谓的制衡。他既不想仲裁庭当中都是陈这样的老奸巨猾，也不会让叶这样的所谓正义当道，为了维护所谓的上层少数人或者说他自己，只能让所谓的好人和坏人来斗争，但性质一样，都是他制衡的工具，这样不难解释为什么最后陈仲裁为什么不会死，但叶必须死，因为陈仲裁是对上层暂时没有太大威胁的坏人，但叶藏风已经成为一个大的隐患（出掉叶再寻找一个新的听话的叶来替代即可）。虽然明末本身就是腐败到骨头的时期，但电影通篇剧情戾气太重，全面碾压打击积极思想，甚至把仅有的希望灭绝，只能说这只是历史的某个瞬间，因为兵器的进化，时代的进步长远看终究还是邪不压正，但所谓的制衡永远不会变，因为人性从来都是这样。